110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0654 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  61.19 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  59.7 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  54.17 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  55.71 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  48.78 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  50 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  42.7 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  44.29 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  38.54 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 240 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  44.71 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  38.38 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  39.47 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  40.96 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  38.04 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.75 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  35.71 
 
 		 585 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  37.14 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  46.15 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4431  HNH endonuclease  48.08 
 
 		 554 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4452  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 555 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.673536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  41.94 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3608  hypothetical protein  36.9 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970476  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 299 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 459 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1766  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  46 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 552 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 459 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 627 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 627 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 635 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 635 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  34.55 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 634 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  33.33 
 
 		 338 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  33.33 
 
 		 338 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  36.51 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 438 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  43.28 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.35 
 
 		 648 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.35 
 
 		 648 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  32.73 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1185  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  32.73 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  40 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1305  HNH endonuclease  35 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.500836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  34.72 
 
 		 422 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  35.71 
 
 		 471 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  38.46 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 388 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 165 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  30.91 
 
 		 168 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  32.81 
 
 		 221 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 165 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 166 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 160 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 234 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  40 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  48.89 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 459 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  34.48 
 
 		 560 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>