18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1185 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1185  HNH endonuclease  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1690  HNH nuclease  39.68 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2473  hypothetical protein  38.71 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3028  hypothetical protein  37.89 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.435693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3324  HNH nuclease  37.04 
 
 		 395 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.95 
 
 		 661 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  32.31 
 
 		 634 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  33.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.03 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.03 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.75 
 
 		 607 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.75 
 
 		 607 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.75 
 
 		 607 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.75 
 
 		 607 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  33.85 
 
 		 338 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  33.85 
 
 		 338 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1232  HNH nuclease  32.91 
 
 		 401 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.531581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>