15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1690 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1690  HNH nuclease  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1185  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3028  hypothetical protein  49.02 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.435693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2473  hypothetical protein  40.21 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3324  HNH nuclease  31.58 
 
 		 395 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  39.68 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1232  HNH nuclease  35.42 
 
 		 401 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.531581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.91 
 
 		 607 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.91 
 
 		 607 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.91 
 
 		 607 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.91 
 
 		 607 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.75 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.75 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>