More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3009 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  100 
 
 		 443 aa  892    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  57.58 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  55.95 
 
 		 442 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  56.73 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  54.57 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  53.58 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  54.18 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  52.27 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  49.89 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  50.8 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  49.77 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  50.11 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  50.84 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  55.79 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  48.85 
 
 		 448 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  50.35 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  50 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  50.7 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  48.23 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  55.16 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  49.52 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  54.92 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  44.6 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  45.86 
 
 		 1049 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  45.95 
 
 		 1023 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1016 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  49.15 
 
 		 413 aa  352  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  45.67 
 
 		 1018 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  45.13 
 
 		 1015 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  44.81 
 
 		 1015 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  45.13 
 
 		 1015 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  45.63 
 
 		 978 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  43.2 
 
 		 994 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1003 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  39.23 
 
 		 966 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  39.44 
 
 		 977 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  43.63 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  39.68 
 
 		 976 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  39.81 
 
 		 967 aa  292  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  39.68 
 
 		 910 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  39.46 
 
 		 976 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  39.95 
 
 		 981 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  38.34 
 
 		 970 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  38.48 
 
 		 970 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  39.95 
 
 		 981 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  39.95 
 
 		 981 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  38.22 
 
 		 973 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  39.49 
 
 		 975 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  37.32 
 
 		 970 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.15 
 
 		 448 aa  276  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  38.53 
 
 		 973 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  39.13 
 
 		 431 aa  266  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  38.83 
 
 		 974 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.68 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  36.11 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  35.73 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  35.4 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  35.75 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.66 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  34.53 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  35 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.4 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  34.72 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  34.21 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  34.19 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  33.48 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 443 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  34.08 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.81 
 
 		 461 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  34.14 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  34.72 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  32.88 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  32.43 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  34.79 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  34 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  32.29 
 
 		 450 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  33.17 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  33.5 
 
 		 452 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  34.07 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  34.76 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.15 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.15 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  30.81 
 
 		 449 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  30.86 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  29.76 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  29.76 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  34.68 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  29.29 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  29.29 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  29.29 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  32.5 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  29.29 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>