More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2806 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  854    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  50.69 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  51.16 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  51.26 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  51.26 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  41.72 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  41.08 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  43.79 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  38.69 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  38.46 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  50.49 
 
 		 314 aa  299  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  37.3 
 
 		 425 aa  290  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  37.19 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  38.8 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  27.19 
 
 		 373 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  27.94 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.36 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.72 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.72 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  23.76 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.06 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.78 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.8 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.61 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.46 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.7 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  21.85 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.89 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.24 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.15 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  33.55 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  23.88 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  37.69 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.53 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  35.62 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  23.87 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  24.6 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.53 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.96 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.88 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  20.69 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  20.38 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.96 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  36.15 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  36.15 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  36.15 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  21.3 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  36.72 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  29.04 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.43 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.82 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.53 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  35.88 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  26.95 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25.32 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1599  lipoprotein releasing system  32.84 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.526116 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.62 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.65 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  27.78 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  32.89 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.13 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  26.23 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  36.64 
 
 		 653 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  33.96 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  32.26 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 		 401 aa  63.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.27 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  20.11 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>