More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1905 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  100 
 
 		 530 aa  1045    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  60.27 
 
 		 533 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  59.69 
 
 		 533 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  58.32 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  59.49 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  60.04 
 
 		 517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  59.41 
 
 		 531 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  59.6 
 
 		 513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  58.32 
 
 		 506 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  56.86 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.42 
 
 		 523 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  55.73 
 
 		 516 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  55.04 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 		 523 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  55.8 
 
 		 516 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  55.35 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  55.27 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  56.31 
 
 		 509 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  55.27 
 
 		 533 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  56.5 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  55.31 
 
 		 521 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  57.52 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  54.78 
 
 		 533 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  56.04 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  56.39 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  57.11 
 
 		 546 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  54.8 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  56.39 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  56.19 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  53.08 
 
 		 511 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  54.76 
 
 		 524 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  55.8 
 
 		 519 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  54.87 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  53.86 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  55.31 
 
 		 514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  56.03 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.11 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  51.19 
 
 		 517 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  54.33 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  55.58 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  52.84 
 
 		 522 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  55.83 
 
 		 534 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  54.02 
 
 		 522 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  55.33 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  55.51 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  54.93 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  55.13 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  55.83 
 
 		 534 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  52.14 
 
 		 544 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  55.39 
 
 		 567 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.2 
 
 		 532 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  53.17 
 
 		 539 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  54.05 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  53.68 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  52.79 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  53.31 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  52.41 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  43.57 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  43.57 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  44.89 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  42.97 
 
 		 511 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  43.26 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  44.44 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  44.51 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  42.74 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.8 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  44.53 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  45.78 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  40.28 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  45.24 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  42.45 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  45.02 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  40.85 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.8 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  41.5 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  44.25 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  41.82 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.53 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.04 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  44.06 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  45.17 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  44.64 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  40.77 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  41.65 
 
 		 528 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>