More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1114 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  100 
 
 		 486 aa  927    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  72.63 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  57.37 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  57.52 
 
 		 494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  57.73 
 
 		 473 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 480 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 		 509 aa  282  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 486 aa  279  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.85 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.76 
 
 		 481 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  39.95 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  39 
 
 		 555 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 513 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  38.32 
 
 		 493 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 		 502 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 485 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.24 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 505 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  37.95 
 
 		 488 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 493 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 480 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  38.5 
 
 		 480 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 484 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  33.27 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 486 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 470 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  35.81 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 471 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.19 
 
 		 489 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 491 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 505 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.79 
 
 		 483 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.2 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  33.4 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 481 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.19 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  34.62 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 		 540 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 522 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  33.81 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  34.36 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.36 
 
 		 500 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.63 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.19 
 
 		 627 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 		 609 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  34.29 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 506 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  34.49 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 486 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  32.95 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.53 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 478 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>