226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4690 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 234 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  70.94 
 
 		 394 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  69.1 
 
 		 394 aa  334  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  70.04 
 
 		 394 aa  331  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  70.04 
 
 		 394 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  69.33 
 
 		 395 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  68.44 
 
 		 394 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  66.67 
 
 		 395 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  66.81 
 
 		 395 aa  304  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  64.91 
 
 		 396 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  67.58 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  65.32 
 
 		 401 aa  296  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  64 
 
 		 393 aa  289  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  63.25 
 
 		 395 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  62.61 
 
 		 396 aa  285  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  59.29 
 
 		 395 aa  265  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  56.84 
 
 		 394 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  56.84 
 
 		 394 aa  255  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  60.18 
 
 		 394 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  57.08 
 
 		 397 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  56.5 
 
 		 395 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  60.18 
 
 		 395 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  60.18 
 
 		 395 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  60.18 
 
 		 409 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  55.61 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  57.08 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  57.08 
 
 		 395 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  53.81 
 
 		 389 aa  244  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  52.02 
 
 		 393 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  51.85 
 
 		 401 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  50.23 
 
 		 395 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  50.7 
 
 		 397 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  50.7 
 
 		 397 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  48.66 
 
 		 406 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  50.7 
 
 		 397 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  51.14 
 
 		 396 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  44.6 
 
 		 458 aa  177  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 466 aa  155  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  43.32 
 
 		 397 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.27 
 
 		 383 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.36 
 
 		 381 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.74 
 
 		 378 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.95 
 
 		 382 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  32.54 
 
 		 392 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.32 
 
 		 413 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  31.3 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  31.75 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.26 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.26 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.83 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  29.96 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.29 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  30.29 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  30.29 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.41 
 
 		 380 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.96 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  29.23 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  29.23 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  29.23 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  28.76 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  30.77 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  28.72 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  31.34 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.24 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  29.34 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  26.91 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  31.9 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  31.9 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  31.9 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  30.35 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  27.73 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  29.85 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  29.85 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  30 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  29.85 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  30 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  30.81 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  30.48 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  28.36 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  30.48 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  29.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  30.85 
 
 		 389 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  30.56 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  28.65 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  27.98 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  28.17 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  26.87 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  25.23 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  46.48 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  27.67 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.37 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.37 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.27 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  31.29 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  28.57 
 
 		 421 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  30.35 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  28.23 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  32.2 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.14 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>