More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3660 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  93.65 
 
 		 388 aa  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  100 
 
 		 380 aa  781    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  93.67 
 
 		 384 aa  719    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  100 
 
 		 380 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  99.74 
 
 		 380 aa  778    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  79.74 
 
 		 380 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  74.74 
 
 		 381 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  73.68 
 
 		 381 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  73.95 
 
 		 381 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  73.95 
 
 		 381 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  73.95 
 
 		 381 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  68.68 
 
 		 381 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  61.64 
 
 		 384 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  55.79 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  51.72 
 
 		 382 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  52.11 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  50 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  37.75 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.85 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  34.26 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  34.95 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  35.35 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  35.82 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  35.82 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  35.82 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.84 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.53 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.53 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.53 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.89 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.05 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.4 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.33 
 
 		 388 aa  182  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  34.34 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  34.72 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.22 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.18 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.02 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  34.09 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.68 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.08 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.58 
 
 		 384 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.33 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.36 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.64 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  33.84 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  33.92 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  34.34 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.57 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  33.69 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 		 390 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.75 
 
 		 389 aa  175  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.44 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  32.66 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  30.18 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  33.17 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  34.81 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.86 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.75 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.41 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.3 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.5 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.58 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  31.58 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.05 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.31 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.31 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.08 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  31.9 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.51 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.06 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  32.57 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  32.62 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  31.65 
 
 		 394 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.79 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  32.32 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  32.19 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  30.87 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  30.47 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.82 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  32.43 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  32.7 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  30.83 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  31.23 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  31.54 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>