More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1529 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  100 
 
 		 390 aa  808    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.09 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  39.13 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.1 
 
 		 417 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  38 
 
 		 392 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  34.42 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.15 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  36.95 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  36.22 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.6 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  35.23 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  36.34 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  32.38 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  32.61 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  32.61 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.81 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  31.91 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  36.63 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  36.44 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  36.63 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  35.99 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  34.34 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  37.02 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.25 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  35.05 
 
 		 394 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.73 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  32.8 
 
 		 396 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  35.92 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  34.7 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.99 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.18 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.18 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.58 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.18 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.33 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.84 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.41 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  33.59 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.45 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  34.27 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.92 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.31 
 
 		 383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  30.53 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  34.4 
 
 		 401 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  35.57 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  35.75 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.1 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.42 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  30.62 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.16 
 
 		 390 aa  186  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  32.64 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.91 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.49 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.82 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  30.5 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  29.85 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  31.12 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  33.86 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.04 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  30.05 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.45 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.98 
 
 		 387 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.55 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  33.08 
 
 		 388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.47 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  34.2 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.66 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  34.19 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.02 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  31.75 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  33.08 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  29.66 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  31.42 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  31.13 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  31.13 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  31.32 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.56 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  31.93 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  32.14 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.93 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  29.85 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  31.66 
 
 		 388 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.3 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  31.82 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  32.27 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  32.09 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>