More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3986 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  100 
 
 		 394 aa  807    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  73.28 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  70.74 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  70.74 
 
 		 394 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  69.21 
 
 		 397 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  70.56 
 
 		 409 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  70.56 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  70.56 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  64.56 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  66.24 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  67.01 
 
 		 394 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  66.16 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  66.75 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  64.63 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  65.63 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  61.38 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  63.13 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  60.66 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  60.56 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  60.15 
 
 		 396 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  61.27 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  60.66 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  61.07 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  60.46 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  59.64 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  61.32 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  56.92 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  58.73 
 
 		 401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  57.87 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  55.84 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  56.35 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  56.09 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  56.35 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  54.57 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  56.2 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  50 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  47.63 
 
 		 466 aa  348  8e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  50.51 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.84 
 
 		 234 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.73 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.13 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  35.99 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  35.96 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.87 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.89 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.79 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  36.54 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.39 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  37.09 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  34.83 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  35.28 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  35.28 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  34.08 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.46 
 
 		 392 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  34.16 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  34.18 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  32.13 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.47 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.46 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  36.79 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  35.14 
 
 		 383 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.58 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  35.7 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 402 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.72 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.17 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  38.64 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.2 
 
 		 465 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  34.17 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  34.55 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.83 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.05 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.23 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  34.75 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.76 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.74 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  35.56 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  33.14 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  33.14 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  34 
 
 		 399 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.08 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  35.89 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  29.43 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.9 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  30.87 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.8 
 
 		 392 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  30.87 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.15 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.74 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.71 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  30.87 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.41 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  33.82 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.66 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>