More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3483 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  100 
 
 		 383 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  58.2 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.95 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  39.13 
 
 		 390 aa  255  9e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  39.74 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  38.83 
 
 		 413 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  39.28 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  38.34 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  38.94 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  38.94 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  37.97 
 
 		 413 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.94 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  37.65 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  42.06 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  39.9 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  39.65 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  38.13 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  38.16 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  38.12 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  39.69 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  39.69 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  39.69 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  36.83 
 
 		 407 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  41.37 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  37.89 
 
 		 396 aa  232  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  35.58 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  40.41 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  38.52 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  37.03 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  38.21 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  39.49 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  37.76 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  39.7 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  40.05 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  37.63 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.95 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  37.73 
 
 		 394 aa  215  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  38.56 
 
 		 388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  38.87 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  37.79 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  38.32 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  38.82 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  39.89 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.82 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  35.58 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  38.92 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  37.06 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.22 
 
 		 392 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  38.01 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  37.79 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  37.79 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  37.96 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36.48 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  37.13 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.19 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  38.14 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.93 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  36.6 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  38.06 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.53 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  34.22 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  38.52 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.25 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.84 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.41 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.57 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  38.34 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  33.42 
 
 		 466 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  36.15 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  38.28 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.71 
 
 		 384 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.45 
 
 		 387 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.36 
 
 		 390 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  37.86 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  36.84 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  32.89 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  36.83 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  38.24 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  34.43 
 
 		 397 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.64 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.44 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.42 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  35.48 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.29 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  37.73 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  35.49 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  35.24 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  38.22 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  36.94 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  38.7 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>