More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3857 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3857  thiolase  100 
 
 		 383 aa  772    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  60.1 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  54.45 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  54.69 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  49.14 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.76 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  34.92 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  32.74 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  32.74 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  32.74 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  32.31 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  33.75 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.91 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.49 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.02 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  32.47 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.92 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  34.42 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  33.17 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  34.46 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.87 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.87 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.87 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  31.08 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  32.58 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  32.72 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  34.37 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  34.2 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  30.99 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  31.3 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  34.46 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.1 
 
 		 394 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.58 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  32.24 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.58 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32.9 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.82 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.76 
 
 		 394 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  30.83 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.05 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.43 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  32.65 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  31.88 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.31 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.54 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.84 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 466 aa  159  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.79 
 
 		 390 aa  159  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  30.83 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  30.83 
 
 		 380 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  30.36 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  30.83 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  31.75 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  31.51 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  31.75 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  31.75 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  31.32 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  29.61 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  29.61 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  31.33 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  30.99 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.85 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.87 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.8 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.24 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  31.7 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.89 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.73 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  32.55 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  31.19 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  30.87 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  32.9 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  31.17 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  31.07 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  30.05 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.51 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  31.18 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.54 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  32.13 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.34 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.71 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  30.48 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  31.83 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.03 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>