More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1611 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  100 
 
 		 394 aa  814    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  60.66 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  60.66 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  61.56 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  62.09 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  62.09 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  60.97 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  59.39 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  60.15 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  59.64 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  60.41 
 
 		 395 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  60.41 
 
 		 395 aa  474  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  59.14 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  58.38 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  59.59 
 
 		 409 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  59.59 
 
 		 395 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  59.59 
 
 		 395 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  58.38 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  58.73 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  58.08 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  60.21 
 
 		 401 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  58.16 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  57.4 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  60.72 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  56.85 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  57.51 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  54.39 
 
 		 389 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  54.52 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  52.66 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  52.78 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  51.01 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  51.01 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  51.01 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  50.37 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  52.64 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  46.72 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  47.74 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  47.24 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  57.08 
 
 		 234 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.21 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  38.31 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  37.97 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  37.06 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  37.06 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.82 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.94 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.5 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  34.29 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.97 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  37.07 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  36.5 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  34.18 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  33.25 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.84 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  35.05 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  34.58 
 
 		 414 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  34.67 
 
 		 413 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  32.61 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.42 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  31.95 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  32.89 
 
 		 384 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.82 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.66 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  32.51 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.84 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.16 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.16 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.16 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  31.76 
 
 		 383 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.89 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.68 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.92 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  33.94 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  32.24 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  34.54 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  31.72 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  31.72 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  31.72 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  31.2 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  31.97 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  31.97 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.83 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.28 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  32.54 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.02 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.33 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.9 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  32.36 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  30.95 
 
 		 388 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  31.42 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  33.85 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.29 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  30.2 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.38 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.73 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>