More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0558 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0558  thiolase  100 
 
 		 407 aa  837    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.65 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.22 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  43.67 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  42.48 
 
 		 413 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  40.49 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  40.44 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.48 
 
 		 413 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  40.48 
 
 		 413 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  40.48 
 
 		 413 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  40.34 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  40.44 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  41.09 
 
 		 414 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  39.47 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  40.15 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  38.83 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  38.55 
 
 		 387 aa  252  7e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.71 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  41.06 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  38.93 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.23 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.02 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.51 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.96 
 
 		 378 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  37.86 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.02 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  37.44 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  36.83 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  37.06 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  36.06 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.9 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.35 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  34.14 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  35.35 
 
 		 393 aa  226  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  36.54 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  36.27 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  36.52 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  38 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  38 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  38 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.37 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.61 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  36.23 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  35.07 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  35.07 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.15 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  35.07 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  35.88 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.54 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.54 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.83 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.05 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.03 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  34.75 
 
 		 397 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.06 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  35.38 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  36.25 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  34.49 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.75 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  36.54 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  34.38 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  33.08 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.22 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  34.09 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  34.99 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  32.45 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  33 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  33 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  33.17 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  33.17 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  33.17 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  32.2 
 
 		 387 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  35.52 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  32.83 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.82 
 
 		 395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.75 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  35.36 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  35.19 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  35.41 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  32.91 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.74 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  34.18 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.66 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  34.24 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.41 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  35.77 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.84 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  33.25 
 
 		 381 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  35 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.28 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  33.74 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  34.26 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>