More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0932 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  100 
 
 		 393 aa  818    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  66.67 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  65.38 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  63.59 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  62.82 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  61.38 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  62.98 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  62.98 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  62.98 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  61.03 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  60.1 
 
 		 394 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  59.9 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  58.72 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  59.74 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  60.81 
 
 		 395 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  56.63 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  56.92 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  57.03 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  55.61 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  56.85 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  55.78 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  57.33 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  56.12 
 
 		 395 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  56.41 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  54.27 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  55.13 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  53.44 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  52.66 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  54.45 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  52.67 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  50.49 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  51.65 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  51.65 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  51.65 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  51.41 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  49.37 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  47.56 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  45.09 
 
 		 466 aa  325  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.16 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.83 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  35.35 
 
 		 407 aa  226  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.87 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  35.23 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.82 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  52.02 
 
 		 234 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.07 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  34.83 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  34.83 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  36.5 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.91 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.33 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.35 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  33.98 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.6 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.5 
 
 		 392 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.71 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  34.01 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.92 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.98 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.26 
 
 		 390 aa  186  8e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.05 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.05 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.05 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.5 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.64 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.77 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  30.56 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  31.31 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.01 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.84 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  30.29 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.73 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.16 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  31.08 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.32 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.48 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  32.53 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  30.05 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  30.77 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.73 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.25 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.66 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  32.15 
 
 		 387 aa  172  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  32.04 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.08 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  30.5 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  30.77 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  30.77 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  30.77 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.22 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  29.5 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>