More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3832 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  100 
 
 		 394 aa  809    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  73.54 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  73.28 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  72.52 
 
 		 394 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  71.17 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  70.3 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  69.39 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  68.02 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  67.35 
 
 		 394 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  64.96 
 
 		 393 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  68.37 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  67.26 
 
 		 395 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  66.24 
 
 		 395 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  64.81 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  65.91 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  65.65 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  65.99 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  65.74 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  64.81 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  64.72 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  64.72 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  64.72 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  61.27 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  60.47 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  58.73 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  56.63 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  57.84 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  56.33 
 
 		 389 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  53.16 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  53.3 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  55.03 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  52.81 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  52.81 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  52.81 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  52.09 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  47.97 
 
 		 458 aa  352  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  51.52 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  70.94 
 
 		 234 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  44.11 
 
 		 466 aa  314  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.69 
 
 		 417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  37.44 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  36.04 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.79 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.86 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  35.77 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  37.16 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.43 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  36.43 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  36.43 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  36.61 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  32.99 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.84 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.91 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.77 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  34.64 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.86 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.51 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  32.79 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.92 
 
 		 392 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  31.9 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.96 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  33.6 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  33.6 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  33.6 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.15 
 
 		 380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  30.18 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  30.18 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  30.18 
 
 		 380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.5 
 
 		 383 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  36.76 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.25 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.58 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  32 
 
 		 381 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  31.22 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  31.73 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.88 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  29.22 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.51 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.1 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.75 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.67 
 
 		 398 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.47 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.25 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.73 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  30.4 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.73 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  28.97 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.05 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.08 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>