More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5101 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  100 
 
 		 413 aa  848    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  60.64 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  58.25 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  57.52 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  55.83 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  55.83 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  55.58 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  54.96 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  49.16 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  49 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.21 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  42.48 
 
 		 407 aa  318  9e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  42.14 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  40.93 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.97 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  37.13 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  37.16 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.25 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  35.02 
 
 		 406 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.82 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.82 
 
 		 387 aa  226  8e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.27 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  37.44 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  37.44 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  37.44 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.17 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  37.34 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  35.01 
 
 		 397 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.45 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.01 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.7 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.24 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  37.66 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.46 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.09 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  35.29 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.35 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.56 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.32 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.63 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.16 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  35.66 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.63 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.52 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  33.91 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  34.9 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.29 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.06 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  34.74 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  34.07 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.79 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  34.18 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  34.24 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  33.41 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.92 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  33.02 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34 
 
 		 392 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  35.28 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  34.33 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  34.67 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.25 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.82 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  36.05 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  35.47 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.08 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.17 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  32.84 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  33 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.1 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.41 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.92 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 394 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.17 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  32.92 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  31.94 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.67 
 
 		 397 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  34.41 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.75 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.61 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  33.58 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  32.67 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  33.58 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.17 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  33.58 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  34.26 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>