More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2149 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  100 
 
 		 397 aa  821    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  62.72 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  62.63 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  63.13 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  63.13 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  63.13 
 
 		 397 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  63.64 
 
 		 396 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  60.29 
 
 		 406 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  49.37 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  52.42 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  51.39 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  50.38 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  52.15 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  52.13 
 
 		 395 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  52.02 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  52.66 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  52.02 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  52.26 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  51.52 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  51.87 
 
 		 394 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  51.51 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  51.39 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  49.87 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  51.39 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  51.39 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  48.11 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  50.51 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  49.49 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  49.87 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  50.25 
 
 		 395 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  50.63 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  52.14 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  47.74 
 
 		 394 aa  352  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  49.75 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  49.63 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  47.73 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  46.84 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  46.77 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  40.41 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  39.56 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  39.16 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.88 
 
 		 417 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  38.46 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  39.05 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  39.05 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.81 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  39.26 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  37.28 
 
 		 413 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  40 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.84 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.08 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.1 
 
 		 392 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  37.62 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  38.36 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.86 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  36.84 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.84 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  37.5 
 
 		 392 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.89 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.57 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  36.79 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.7 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.33 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  34.01 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.87 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  36.74 
 
 		 421 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.42 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.26 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.07 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  37.68 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  34.66 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.82 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  37.06 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  34.99 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.42 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.48 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  33.87 
 
 		 392 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.88 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.65 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  37.99 
 
 		 398 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.09 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.77 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 		 392 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.29 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.77 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.89 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.31 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.01 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.15 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.37 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.86 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  34.16 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.08 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.17 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>