More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2338 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  100 
 
 
396 aa  821    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  82.74 
 
 
397 aa  685    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  82.49 
 
 
397 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  79.95 
 
 
395 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  82.74 
 
 
397 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  78.27 
 
 
406 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  81.98 
 
 
401 aa  683    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  63.64 
 
 
397 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  54.8 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  56.2 
 
 
394 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  56.31 
 
 
394 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  54.45 
 
 
393 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  54.77 
 
 
395 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  56.17 
 
 
395 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  54.36 
 
 
395 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  54.08 
 
 
458 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  54.8 
 
 
394 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  55.28 
 
 
394 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  55.03 
 
 
394 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  55.16 
 
 
394 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  53.25 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  54.77 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  53.4 
 
 
395 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  53.77 
 
 
409 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  51.5 
 
 
395 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  53.77 
 
 
395 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  53.77 
 
 
395 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  52.51 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  53.15 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  53.77 
 
 
394 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  52.64 
 
 
394 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  54.76 
 
 
395 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  50.5 
 
 
397 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  51.28 
 
 
389 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  51.54 
 
 
401 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  50.52 
 
 
389 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  49.75 
 
 
466 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  51.41 
 
 
396 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  38.37 
 
 
413 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  38.05 
 
 
413 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  38.37 
 
 
413 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.12 
 
 
413 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.04 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.89 
 
 
383 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  37.13 
 
 
413 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  38.96 
 
 
414 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  36.86 
 
 
412 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  36.23 
 
 
413 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36 
 
 
387 aa  222  8e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  37.31 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.93 
 
 
390 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  36.16 
 
 
413 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.46 
 
 
378 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  35.38 
 
 
407 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.68 
 
 
392 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.15 
 
 
392 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.48 
 
 
392 aa  216  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.06 
 
 
390 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.43 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 
388 aa  210  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.77 
 
 
382 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.61 
 
 
387 aa  209  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 
390 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  51.14 
 
 
234 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 
388 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.92 
 
 
383 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 
388 aa  205  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.58 
 
 
394 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 
386 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.82 
 
 
388 aa  202  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  35.15 
 
 
402 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.97 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.11 
 
 
391 aa  199  9e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  36.76 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  35.04 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.23 
 
 
384 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.68 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 
392 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.86 
 
 
390 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.5 
 
 
384 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.13 
 
 
387 aa  192  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  34.06 
 
 
399 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  34.06 
 
 
399 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  34.06 
 
 
399 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  35.56 
 
 
382 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  34.19 
 
 
421 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.57 
 
 
387 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.4 
 
 
397 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  37.75 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  36.87 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 
392 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.11 
 
 
387 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  32.85 
 
 
399 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.32 
 
 
389 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
392 aa  189  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.24 
 
 
386 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  34.38 
 
 
383 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.74 
 
 
387 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  32.6 
 
 
399 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>