More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1472 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
417 aa  852    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  50.71 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  50.95 
 
 
413 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  50.95 
 
 
413 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  49.64 
 
 
413 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  50.36 
 
 
413 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.12 
 
 
465 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  49.16 
 
 
413 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  48.68 
 
 
412 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  48.92 
 
 
413 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  42.65 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  45.41 
 
 
421 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  45.5 
 
 
414 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  43.45 
 
 
392 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  39.95 
 
 
383 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  36.1 
 
 
390 aa  245  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.38 
 
 
378 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  37.65 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  35.4 
 
 
395 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  36.95 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.53 
 
 
386 aa  239  9e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.43 
 
 
387 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 
388 aa  236  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  34.53 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  35.42 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  34.95 
 
 
397 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  34.95 
 
 
397 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  34.95 
 
 
397 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  35.96 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  36.76 
 
 
390 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  37.59 
 
 
401 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 
388 aa  229  8e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  37.77 
 
 
395 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  38.74 
 
 
395 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.17 
 
 
392 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  35.12 
 
 
397 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.46 
 
 
392 aa  227  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.7 
 
 
394 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  37.04 
 
 
396 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  36.87 
 
 
393 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.29 
 
 
390 aa  222  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  36.63 
 
 
384 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  37.96 
 
 
409 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  35.93 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  37.96 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  37.96 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  36.39 
 
 
389 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.99 
 
 
392 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  35.66 
 
 
397 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  36.98 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  37.29 
 
 
394 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 
392 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  36.01 
 
 
395 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  37.29 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  35.35 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  35.52 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  36.69 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  38.04 
 
 
394 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.62 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  37.5 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  36.81 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  38.16 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  35.58 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  36.26 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  35.83 
 
 
394 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.92 
 
 
387 aa  211  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  36.73 
 
 
388 aa  209  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  35.94 
 
 
394 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.72 
 
 
387 aa  206  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 
387 aa  206  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  36.49 
 
 
387 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  34.46 
 
 
389 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  35.87 
 
 
394 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.16 
 
 
390 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  36.95 
 
 
396 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  34.76 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.13 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  35.5 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  35.59 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.85 
 
 
387 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  35.71 
 
 
388 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  35.45 
 
 
395 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.38 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.94 
 
 
388 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.97 
 
 
391 aa  193  6e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.14 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  34.14 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.18 
 
 
402 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.86 
 
 
387 aa  189  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.26 
 
 
399 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  33.03 
 
 
458 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.41 
 
 
417 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.26 
 
 
399 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.26 
 
 
399 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.51 
 
 
380 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  33.26 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 
392 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>