More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3568 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  88.69 
 
 
402 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  100 
 
 
399 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  97.99 
 
 
399 aa  781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  93.73 
 
 
399 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  89.72 
 
 
399 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  89.97 
 
 
399 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  93.98 
 
 
399 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  89.72 
 
 
399 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  69.54 
 
 
398 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  68.89 
 
 
394 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  63.64 
 
 
398 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  65.48 
 
 
393 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  34.15 
 
 
401 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  34.91 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.33 
 
 
395 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.26 
 
 
417 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
406 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  33.01 
 
 
397 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  33.01 
 
 
397 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  32.76 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  32.6 
 
 
396 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  34.09 
 
 
380 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  34.09 
 
 
380 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  34.09 
 
 
380 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.99 
 
 
383 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  34.65 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 
387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.56 
 
 
395 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  34.17 
 
 
394 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.84 
 
 
381 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  35.71 
 
 
409 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  35.71 
 
 
395 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  35.71 
 
 
395 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 
386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.89 
 
 
392 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 
392 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  34.65 
 
 
388 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.07 
 
 
394 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.36 
 
 
378 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 
388 aa  176  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.84 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.32 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  33.9 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  35.15 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.48 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  34.56 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.09 
 
 
395 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  32.91 
 
 
381 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  33.75 
 
 
384 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.48 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.8 
 
 
394 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.94 
 
 
413 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.19 
 
 
392 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.89 
 
 
394 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  32.41 
 
 
381 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.16 
 
 
382 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  34.65 
 
 
389 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.85 
 
 
383 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  32.27 
 
 
390 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  34.91 
 
 
395 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.36 
 
 
390 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  34.64 
 
 
395 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.96 
 
 
387 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  34.13 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.45 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.45 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.45 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.24 
 
 
382 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.22 
 
 
388 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  33.91 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  34.58 
 
 
394 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.58 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.18 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.99 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  33.75 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.9 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  33.66 
 
 
394 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.09 
 
 
394 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.51 
 
 
383 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  33.73 
 
 
397 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  33.17 
 
 
401 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32.75 
 
 
393 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.93 
 
 
413 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.02 
 
 
395 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.08 
 
 
380 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.6 
 
 
394 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 
388 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  30.66 
 
 
397 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  31.17 
 
 
396 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  30.81 
 
 
412 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.71 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  30.48 
 
 
413 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  32.67 
 
 
382 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 
466 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.29 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  30.29 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  30.29 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.3 
 
 
392 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>