More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3556 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 383 aa  788    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  58.73 
 
 		 382 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  57.44 
 
 		 382 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  54.23 
 
 		 381 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.81 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  50.26 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  50 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  53.28 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  50 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  50 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  49.61 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  50.13 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  50.13 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  49.61 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  50.13 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  48.95 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  48.68 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  34.09 
 
 		 396 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.67 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  31.5 
 
 		 395 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  34.16 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  31.5 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  33 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  32.25 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.75 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  30.58 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  32.59 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  32.25 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  32.66 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.84 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  33 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  32.41 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  32.41 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  32.41 
 
 		 409 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  31.61 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  34.86 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.86 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  31.55 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.96 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  29.95 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.98 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  31.11 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 393 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  32.32 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  31.69 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  30.81 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  30.61 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32.16 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  32.41 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  29.93 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  30.95 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  31.89 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.74 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  32.31 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  30.68 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  32.98 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  29.8 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.58 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  30.3 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.89 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.71 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  32.71 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  30.3 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  30.3 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.65 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  32.89 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.88 
 
 		 384 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  29.52 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  31.47 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.13 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.58 
 
 		 387 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  28.93 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  28.33 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  28.33 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.58 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  30.59 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  29.23 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  31.5 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  27.03 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.1 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  32.08 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  30.77 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  30.36 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  30.17 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  29.86 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>