More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0628 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  80.57 
 
 
384 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  100 
 
 
386 aa  787    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  79.74 
 
 
386 aa  630  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  77.02 
 
 
384 aa  626  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  76.49 
 
 
389 aa  608  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  75.45 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  76.58 
 
 
383 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  59.32 
 
 
395 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.12 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.89 
 
 
378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  43.15 
 
 
387 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
388 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  43.44 
 
 
386 aa  290  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  42.2 
 
 
387 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  41.65 
 
 
390 aa  279  6e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
390 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  40.98 
 
 
388 aa  276  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  42.16 
 
 
388 aa  272  6e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  40.53 
 
 
388 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  39.14 
 
 
392 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 
392 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  39.14 
 
 
392 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  41.82 
 
 
388 aa  249  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  39.13 
 
 
394 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.4 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.69 
 
 
392 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  39.53 
 
 
388 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  37.63 
 
 
387 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  38.72 
 
 
394 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  38.01 
 
 
390 aa  240  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.31 
 
 
392 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  40.78 
 
 
387 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.46 
 
 
388 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  37.76 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  37.98 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.67 
 
 
387 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.64 
 
 
392 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  37.18 
 
 
387 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  37.8 
 
 
392 aa  229  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.6 
 
 
387 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  37.34 
 
 
395 aa  224  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.69 
 
 
388 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  37.28 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  35.11 
 
 
396 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  36.96 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  35.31 
 
 
387 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  35.95 
 
 
395 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  37.29 
 
 
390 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.95 
 
 
386 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  35.84 
 
 
389 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  36.96 
 
 
395 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  37.66 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  35.28 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.25 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  34.68 
 
 
389 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  33.84 
 
 
392 aa  195  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.05 
 
 
412 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.42 
 
 
383 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 
388 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 
389 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  34.42 
 
 
389 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.31 
 
 
413 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.46 
 
 
392 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  34.42 
 
 
396 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.67 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.82 
 
 
417 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.7 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.7 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.44 
 
 
413 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 
404 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  32.57 
 
 
395 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  32.91 
 
 
397 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  32.91 
 
 
397 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  31.59 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  32.65 
 
 
397 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.65 
 
 
401 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  31.28 
 
 
414 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  34.01 
 
 
386 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.33 
 
 
397 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.32 
 
 
380 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.07 
 
 
378 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.32 
 
 
380 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.32 
 
 
380 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  32.64 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  30.87 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  31.44 
 
 
406 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 
389 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  33.08 
 
 
388 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 
400 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.01 
 
 
413 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  32.99 
 
 
384 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.41 
 
 
398 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>