More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4071 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  100 
 
 		 395 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  68.89 
 
 		 395 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  69.33 
 
 		 394 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  68.56 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  64.52 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  65.63 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  64.01 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  63.52 
 
 		 395 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  65.37 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  65.37 
 
 		 394 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  65.13 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  65.89 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  63.85 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  65.89 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  65.89 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  65.89 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  64.01 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  62.37 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  61.95 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  62.89 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  60.47 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  60.81 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  59.79 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  59.59 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  60.31 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  57.51 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  56.3 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  53.71 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  55.01 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  53.81 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  53.81 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  53.81 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  53.08 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  51.49 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  54.76 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  47.27 
 
 		 458 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  49.75 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  46 
 
 		 466 aa  316  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.5 
 
 		 234 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  39.5 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  39.9 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  37.34 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.26 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  36.3 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  37.91 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  37.91 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.91 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  38.4 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.28 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.49 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  34.24 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.39 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  36.1 
 
 		 384 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  37.25 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  37.91 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  37.34 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.25 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.25 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  34.55 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.02 
 
 		 386 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.31 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  35.26 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  30.4 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.26 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 392 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.49 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.08 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  34.5 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  34.5 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.86 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  34.5 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.68 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.57 
 
 		 380 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.57 
 
 		 380 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.57 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.19 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.52 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  32.06 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.83 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  36.47 
 
 		 398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.41 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  32.41 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.85 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.62 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.92 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.27 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.16 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.51 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.85 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  32.88 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  32.07 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.49 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.82 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.06 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>