More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 382 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  72.63 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  64.72 
 
 		 382 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  58.73 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  55.87 
 
 		 381 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  55.87 
 
 		 381 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  55.87 
 
 		 381 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.28 
 
 		 381 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  55.61 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  59.07 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  55.61 
 
 		 381 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  55.79 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  55.79 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  55.79 
 
 		 380 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  53.05 
 
 		 384 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  54.31 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  52.99 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  36.54 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  38.01 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  36.04 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  39.14 
 
 		 398 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  38.21 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  37.28 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  36.44 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  36.29 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  36.56 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  36.43 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.52 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  36.91 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  36.2 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  37.34 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36.73 
 
 		 395 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  35.41 
 
 		 389 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  34.35 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  35.95 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  35.95 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  35.95 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  34.01 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  38.6 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.28 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.74 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.61 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  36 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.37 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  35.05 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 		 390 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  37.25 
 
 		 395 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  37.28 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  37.59 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  37.28 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  37.28 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.4 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.81 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.86 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.55 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.55 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  33.51 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  34.44 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  34.95 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.92 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  35.56 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  34.3 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  37.06 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.11 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.48 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  36.22 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.84 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  33.94 
 
 		 384 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.36 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.05 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.25 
 
 		 417 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.48 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.16 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.64 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.85 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  34.01 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.57 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.42 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  34.92 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  34.92 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  34.92 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.09 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  32.83 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.3 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.07 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.09 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>