More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0669 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  100 
 
 		 389 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  80.67 
 
 		 389 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  60.61 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  59.85 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  59.08 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  59.34 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  58.82 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  57.84 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  58.06 
 
 		 395 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  56.63 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  58.25 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  56.92 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  56.44 
 
 		 394 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  56.74 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  56.15 
 
 		 395 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  56.41 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  54.9 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  54.73 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  57.14 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  56.89 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  57.11 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  56.89 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  56.89 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  56.89 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  56.3 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  54.39 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  55.58 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  52.67 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  50.77 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  50.64 
 
 		 395 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  50 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  50 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  49.26 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  50 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  51.28 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  48.11 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  46.43 
 
 		 458 aa  328  8e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  43.43 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  54.31 
 
 		 234 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.39 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.56 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  37.56 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  37.56 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  37.56 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  35.73 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.45 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.74 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  36.82 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.22 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.68 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  35.41 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.67 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.58 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  32.64 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.65 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  34.3 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.74 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  33.17 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.98 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  31.94 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.28 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  34.56 
 
 		 402 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  30.53 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.09 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  35 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.38 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.66 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.02 
 
 		 392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  34.64 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  34.64 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  34.64 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  32.11 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  34.72 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.58 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.69 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.1 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.84 
 
 		 386 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  33.75 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.87 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  31.33 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.92 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.31 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.89 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.32 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  30.29 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  33.43 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  30.13 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.26 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.89 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.58 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  35.33 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.09 
 
 		 386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  34.45 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.91 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  32.04 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.75 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>