More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2602 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  100 
 
 		 382 aa  775    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  70.53 
 
 		 384 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  63.14 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  54.45 
 
 		 383 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  51.89 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  38.12 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  36.25 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.93 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  37.02 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  36.15 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  40.2 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  38.22 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  38.22 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  38.22 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.67 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  36.64 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.8 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  36.13 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  38.18 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  33.77 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  35.19 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  36.39 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  36.15 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36.72 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.34 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  35.82 
 
 		 394 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  36.36 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  36.92 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  34.29 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  36.75 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  33.77 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  35.38 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.91 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.94 
 
 		 392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.17 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  35.86 
 
 		 395 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  32.82 
 
 		 413 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  32.82 
 
 		 413 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  36 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.43 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.82 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  34.55 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.28 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  34.37 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.31 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  34.64 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.55 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.32 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.94 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  34.2 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.16 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.11 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.46 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.82 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.85 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  34.72 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  34.72 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  34.01 
 
 		 397 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  34.72 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  35.32 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  33.42 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  33.86 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.63 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  34.52 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.57 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  33.59 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  34.29 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.9 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.05 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.15 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  31.44 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.81 
 
 		 381 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  32.89 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  32.05 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.37 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  31.94 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.28 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.28 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.28 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  35.62 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  32.84 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 		 466 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.62 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  31.01 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  31.19 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  31.68 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>