More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4527 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  95.49 
 
 		 399 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  90.48 
 
 		 399 aa  736    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  97.99 
 
 		 399 aa  781    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  88.44 
 
 		 402 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  90.23 
 
 		 399 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  100 
 
 		 399 aa  812    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  95.24 
 
 		 399 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  90.23 
 
 		 399 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  69.29 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  68.64 
 
 		 394 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  63.64 
 
 		 398 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  65.16 
 
 		 393 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  34.15 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  33.01 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  34.34 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  34.34 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.99 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  34.34 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.79 
 
 		 417 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  32.35 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  34.65 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.07 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.93 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.84 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  34.9 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.36 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.57 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  34.22 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  33.17 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.64 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  35.82 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.78 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.84 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.73 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.73 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.73 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.68 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  33.75 
 
 		 384 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.84 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.48 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  32.91 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.78 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.84 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  34.48 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.48 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.36 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  32.53 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.41 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.22 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.61 
 
 		 413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  34.23 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  34.16 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.18 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  34.41 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.18 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.18 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.45 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  34.16 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  32.99 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  31.82 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  33.83 
 
 		 394 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.58 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.13 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.78 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  33.17 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.23 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.89 
 
 		 383 aa  159  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  33.07 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  33.9 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  30.9 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  31.44 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.34 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.93 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 466 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  30.71 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.04 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  33.82 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  30.99 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  32.18 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.47 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.65 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.31 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>