More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4396 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  83.76 
 
 
401 aa  707    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  100 
 
 
397 aa  825    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  81.48 
 
 
406 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  99.75 
 
 
397 aa  824    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  82.49 
 
 
396 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  99.75 
 
 
397 aa  824    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  84.77 
 
 
395 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  63.13 
 
 
397 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  56.35 
 
 
394 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  54.22 
 
 
397 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  54.82 
 
 
395 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  56.09 
 
 
394 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  55.58 
 
 
394 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  53.15 
 
 
395 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  53.18 
 
 
394 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  52.55 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  54.71 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  54.18 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  52.42 
 
 
394 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  51.65 
 
 
393 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  51.39 
 
 
395 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  54.82 
 
 
394 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  52.81 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  52.81 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  51.89 
 
 
396 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  53.81 
 
 
395 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  53.03 
 
 
395 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  53.3 
 
 
409 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  53.03 
 
 
395 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  50.62 
 
 
466 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  51.01 
 
 
394 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  50.76 
 
 
393 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  50.51 
 
 
397 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  52.41 
 
 
395 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  50.63 
 
 
401 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  50 
 
 
389 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  48.45 
 
 
389 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  48.59 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.95 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  37.31 
 
 
413 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.68 
 
 
383 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  36.41 
 
 
413 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  36.41 
 
 
413 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  38.5 
 
 
414 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  37.47 
 
 
413 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.94 
 
 
378 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.91 
 
 
413 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.01 
 
 
387 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  37.34 
 
 
392 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  35.91 
 
 
412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.51 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  32.38 
 
 
390 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.91 
 
 
413 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  34.98 
 
 
413 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  35.07 
 
 
407 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.42 
 
 
382 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 
390 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 
388 aa  202  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.17 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.5 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.66 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.94 
 
 
388 aa  200  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.83 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.66 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.43 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.2 
 
 
387 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  31.75 
 
 
390 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.83 
 
 
402 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.81 
 
 
388 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 
387 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 
386 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  50.7 
 
 
234 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.74 
 
 
383 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.58 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.17 
 
 
384 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  35.95 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.41 
 
 
397 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
388 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  29.81 
 
 
417 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.66 
 
 
386 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.35 
 
 
391 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.68 
 
 
387 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.12 
 
 
387 aa  186  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.01 
 
 
383 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.41 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.41 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.41 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  32.52 
 
 
399 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.01 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.6 
 
 
390 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  32.27 
 
 
399 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  31.34 
 
 
392 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  32.76 
 
 
399 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  32.93 
 
 
421 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  34.82 
 
 
392 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  33.77 
 
 
387 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  31.66 
 
 
394 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  31.71 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>