More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3389 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  77.95 
 
 		 381 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 380 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  76.9 
 
 		 381 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  78.22 
 
 		 381 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  79.74 
 
 		 380 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  78.22 
 
 		 381 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  79.74 
 
 		 380 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  78.22 
 
 		 381 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  79.74 
 
 		 380 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  78.89 
 
 		 384 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  79.1 
 
 		 388 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  73.23 
 
 		 381 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  61.38 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  54.62 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.84 
 
 		 380 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  53.28 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  34.84 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.75 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.76 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.77 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.48 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  33.76 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.11 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 392 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  34.78 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.84 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.85 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.77 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  31.55 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  31.99 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  32.61 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  31.52 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.38 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.93 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.07 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  33.08 
 
 		 412 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.5 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.22 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  34.35 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.31 
 
 		 388 aa  170  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  33.58 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  33.58 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  34.5 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  32.98 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.16 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.89 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.9 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.42 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  33.24 
 
 		 394 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.55 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.9 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.95 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.33 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  33.6 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.3 
 
 		 390 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.06 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  31.28 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  31.83 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.06 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  34.05 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  33.84 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.74 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  32.01 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  33.76 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  31.77 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  32.63 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.47 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  32.41 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  31.81 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  33.24 
 
 		 383 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.24 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  31.75 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  32.49 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.82 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  31.59 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.39 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32.1 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.27 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.21 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  31.09 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.9 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.09 
 
 		 413 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.14 
 
 		 397 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  32.18 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.1 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>