More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3588 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 		 380 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  72.63 
 
 		 382 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  59.42 
 
 		 382 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  55.53 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  55.26 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  55.53 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  55.53 
 
 		 381 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  56.81 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.84 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  53.42 
 
 		 381 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  53.95 
 
 		 381 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  52.11 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  52.11 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  52.11 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  52.52 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  51.46 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  49.07 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  37 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  36.16 
 
 		 397 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  35.98 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  34.26 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  36.02 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  38.52 
 
 		 395 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  38.52 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  38.52 
 
 		 395 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  34.19 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  35.38 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.11 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  33.5 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  33.5 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  33.42 
 
 		 413 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  34.1 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  35.75 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  35.52 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.88 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  34.78 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  36.8 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.26 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.06 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.93 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  30.75 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  34.34 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.97 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  35.53 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  34.34 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.08 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.99 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.88 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  33.59 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  32.41 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.12 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  31.71 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  31.71 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  31.71 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  35.84 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.59 
 
 		 387 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.31 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  32.74 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  31.58 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  34.92 
 
 		 394 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  32.74 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  30.79 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.02 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.49 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.82 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  33.25 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.75 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  32.08 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  33.15 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  31.23 
 
 		 413 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  31.58 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.42 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  32.58 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  32.58 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  32.58 
 
 		 399 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  33.51 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.8 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.06 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.33 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  31.9 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  30.56 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  32.17 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  31.4 
 
 		 392 aa  149  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.23 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  31.64 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.14 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  33.05 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>