More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3070 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 400 aa  826    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  84.75 
 
 		 400 aa  686    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  69.23 
 
 		 404 aa  578  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  65.74 
 
 		 398 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  62.84 
 
 		 401 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.73 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.09 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  41.73 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  38.15 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.78 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  38.01 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.92 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  37.17 
 
 		 388 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.1 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.1 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.75 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.66 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  36.86 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  36.08 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.41 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.64 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.01 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  34.7 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  37.87 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  37.03 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.27 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  35.19 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.69 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.7 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.93 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  35.61 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  36.86 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.49 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.71 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  33.9 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  37.36 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  35.93 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.01 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  34 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.99 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  35.34 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  31.81 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  33.84 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.71 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.39 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 389 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.22 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  31.71 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.84 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  32.27 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  32.76 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  32.57 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 		 389 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.66 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.94 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.94 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.94 
 
 		 409 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  30.85 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  31.59 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.14 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.71 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  30.1 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  32.67 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  30.08 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  35.58 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.06 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  31.59 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  33.42 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  34.09 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  29.43 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  34.42 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  31.7 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  30 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  36.96 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.33 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  35.83 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  30.26 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  31.47 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  30.37 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  30.99 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.13 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  30.33 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  30.33 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  31.27 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.81 
 
 		 383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  32.11 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.13 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.46 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>