More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0040 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0040  thiolase  100 
 
 		 421 aa  866    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.41 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  47.14 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  45.95 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.28 
 
 		 465 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  45.95 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  45.13 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  45.13 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  44.52 
 
 		 412 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.66 
 
 		 413 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  46.34 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  39.47 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  42.14 
 
 		 413 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  41.35 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.79 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  35.76 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.25 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.54 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  36.47 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  37.91 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.59 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.96 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.63 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.8 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.89 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.89 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.92 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.29 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.99 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.15 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.08 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  35.82 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  35.28 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.87 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.78 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.66 
 
 		 381 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  30.5 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  32.79 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  32.7 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  32.93 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  32.93 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.15 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  32.93 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  34.19 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.72 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  37.86 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  34.98 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  34.3 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  33.8 
 
 		 395 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  32.95 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  33.09 
 
 		 392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  35.73 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.95 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  35.43 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.56 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  35.43 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  35.43 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  35.28 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  32.7 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  36.34 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.99 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  31.23 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  33.66 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  33.33 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.84 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  34.39 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  34.04 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.75 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.84 
 
 		 382 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  32.23 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.83 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.83 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  33.08 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.83 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  33.08 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  29.83 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.55 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  33.64 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  32.79 
 
 		 397 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  32.07 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.65 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  33.26 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  32.94 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  33.18 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  32.37 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  32.58 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  30.99 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  33.41 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  32.95 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  32.52 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  32.07 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  32.65 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>