More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4119 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  100 
 
 		 401 aa  812    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  75.38 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  70.1 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  69.39 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  70.62 
 
 		 394 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  69.59 
 
 		 395 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  70.62 
 
 		 394 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  66.15 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  66.67 
 
 		 395 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  64.72 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  65.38 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  63.36 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  63.43 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  62.05 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  60.36 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  60.51 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  62.37 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  61.07 
 
 		 394 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  62.82 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  61.22 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  61.73 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  61.73 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  60.9 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  60.21 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  60.41 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  56.99 
 
 		 389 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  57.11 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  55.13 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  51.54 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  50.63 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  51.28 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  50.63 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  49.63 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  50.63 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  51.54 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  46.35 
 
 		 458 aa  333  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  49.63 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  45.25 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  65.32 
 
 		 234 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.59 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.85 
 
 		 413 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  40.1 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  39.36 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  39.36 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  38.39 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  39.22 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  38.89 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  36.56 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  35.29 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  35.19 
 
 		 407 aa  196  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  38.86 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  34.4 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.31 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.81 
 
 		 383 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.12 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.25 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.82 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.9 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  34.98 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.48 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.62 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  34.18 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  34.36 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  34.13 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.19 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  32.24 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.17 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.57 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.19 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.19 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  31.27 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.01 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  35 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.19 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.57 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.9 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.55 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  31.62 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  30.79 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  33.43 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  33.43 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  33.43 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  31.35 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.53 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  35.48 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  30.5 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.09 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.25 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  36.18 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  31.13 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.2 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.25 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  31.13 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  31.13 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>