More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1826 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  86.88 
 
 
381 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  85.56 
 
 
381 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  100 
 
 
381 aa  784    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  100 
 
 
381 aa  784    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  100 
 
 
381 aa  784    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  78.22 
 
 
380 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  73.95 
 
 
380 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  73.95 
 
 
380 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  73.95 
 
 
380 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  74.14 
 
 
384 aa  590  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  73.02 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  69.82 
 
 
381 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  60.85 
 
 
384 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  52.51 
 
 
382 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
382 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  55.53 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  50.13 
 
 
383 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  37.06 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.17 
 
 
407 aa  199  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.95 
 
 
378 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 
386 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.68 
 
 
388 aa  179  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.33 
 
 
417 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  34.32 
 
 
397 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 
390 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.87 
 
 
387 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  34.26 
 
 
398 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  33.78 
 
 
383 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  33.6 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  32.74 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 
390 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.98 
 
 
391 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  32.72 
 
 
384 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.51 
 
 
395 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  30.77 
 
 
393 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.91 
 
 
394 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.41 
 
 
387 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.39 
 
 
394 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 
390 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
387 aa  169  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  33.51 
 
 
395 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.16 
 
 
394 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  34.13 
 
 
395 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.28 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.68 
 
 
394 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  34.1 
 
 
387 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.71 
 
 
388 aa  166  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  31.2 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  32.83 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  31.46 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  33.87 
 
 
394 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  32.67 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  32.67 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  32.67 
 
 
399 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  31.49 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.87 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.21 
 
 
395 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.21 
 
 
395 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  32.37 
 
 
394 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.17 
 
 
387 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.21 
 
 
409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.72 
 
 
394 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.23 
 
 
392 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 
392 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  32.45 
 
 
399 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  31.67 
 
 
399 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  32.28 
 
 
394 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.98 
 
 
387 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  31.67 
 
 
399 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  31.75 
 
 
383 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.56 
 
 
386 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  32.71 
 
 
399 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30 
 
 
392 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  32.46 
 
 
394 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.73 
 
 
395 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.5 
 
 
413 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  29.27 
 
 
383 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.87 
 
 
387 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  32.9 
 
 
393 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.52 
 
 
384 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.34 
 
 
386 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  32.63 
 
 
396 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.74 
 
 
392 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.88 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  30.33 
 
 
390 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.7 
 
 
389 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  30.03 
 
 
397 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  33.42 
 
 
395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.6 
 
 
384 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  30.75 
 
 
417 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  28.69 
 
 
390 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.22 
 
 
413 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  28.83 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  28.83 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  31.13 
 
 
401 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  31.25 
 
 
414 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  32.45 
 
 
389 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  30.45 
 
 
395 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.87 
 
 
387 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  31.13 
 
 
395 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>