More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8928 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
394 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  73.9 
 
 
398 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  71.79 
 
 
398 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  70.18 
 
 
402 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  69.41 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  69.41 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  69.41 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2862  lipid-transfer protein  69.41 
 
 
399 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4527  lipid-transfer protein  68.64 
 
 
399 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0591575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  68.89 
 
 
399 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3366  lipid-transfer protein  69.15 
 
 
399 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  68.48 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  34.18 
 
 
380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  34.18 
 
 
380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  34.18 
 
 
380 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  36.76 
 
 
388 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.76 
 
 
395 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  34.5 
 
 
396 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33.75 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  33.08 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  34.36 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  35.48 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  34.5 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.1 
 
 
381 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.76 
 
 
378 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3389  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.84 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0952002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  33.84 
 
 
388 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  33.59 
 
 
384 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.41 
 
 
392 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  32.91 
 
 
381 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  32.91 
 
 
381 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  32.91 
 
 
381 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.92 
 
 
401 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  35.66 
 
 
394 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.74 
 
 
394 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  34.24 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  34.99 
 
 
383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  35.09 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  35.06 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  35 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.84 
 
 
390 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  33.17 
 
 
395 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  32.66 
 
 
381 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  31.92 
 
 
397 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  31.92 
 
 
397 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  31.92 
 
 
397 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  32.66 
 
 
381 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  34.91 
 
 
394 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  34.42 
 
 
387 aa  167  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
387 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  34.9 
 
 
394 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  35 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  33.67 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  34.46 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  34.41 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  34.85 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  35 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  35 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  32.06 
 
 
383 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.54 
 
 
417 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.76 
 
 
413 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  34.59 
 
 
394 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  32.93 
 
 
413 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.23 
 
 
387 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.71 
 
 
395 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  34.76 
 
 
396 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.07 
 
 
387 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  33.75 
 
 
394 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.63 
 
 
386 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  32.18 
 
 
382 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  33.17 
 
 
395 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.34 
 
 
387 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
392 aa  158  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  30.66 
 
 
413 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.4 
 
 
412 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 
387 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  34.01 
 
 
395 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.42 
 
 
383 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  33.17 
 
 
393 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.17 
 
 
390 aa  156  7e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.55 
 
 
384 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.2 
 
 
391 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.86 
 
 
387 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.51 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.74 
 
 
388 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  32.76 
 
 
417 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  32.11 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.24 
 
 
392 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  31.62 
 
 
407 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  33.51 
 
 
388 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  32.35 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  32.35 
 
 
413 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
388 aa  150  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.92 
 
 
392 aa  149  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.03 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  31.99 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>