More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6295 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  100 
 
 		 392 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.45 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  43.92 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  43.8 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  44.07 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  42.58 
 
 		 412 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  43.69 
 
 		 413 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.89 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  41.89 
 
 		 413 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  41.89 
 
 		 413 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  43.07 
 
 		 414 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  41.28 
 
 		 413 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  41.35 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.73 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  38.32 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  40.15 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  39.4 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  38.54 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  38 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.03 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  39.11 
 
 		 387 aa  234  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  37.24 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  38.23 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  39.65 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  39.03 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.79 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  37.6 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  37.6 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  37.6 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  36.57 
 
 		 406 aa  225  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.01 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  37.15 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  38.89 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  37.97 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.32 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  38.01 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  38.2 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  47.62 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  36.41 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  36.97 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.98 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.98 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  37.03 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.93 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.98 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  38.78 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  37.34 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  37.53 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  36.66 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.25 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  37.83 
 
 		 384 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.94 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 		 394 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  35.82 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  36.2 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.34 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36.48 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  38.25 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  38.25 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  38.25 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  36.14 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  35.68 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  34.58 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  37.08 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  34.67 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  34.76 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.63 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.37 
 
 		 392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  32.83 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  36.39 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  37 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  34.35 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  36.11 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  34.76 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.93 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  33.94 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  34.83 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  33.94 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  33.94 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.47 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  37 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  34.04 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.81 
 
 		 390 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.16 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.72 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  34.92 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  36.12 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  35.37 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  35.4 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>