More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3077 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  83.03 
 
 		 389 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 389 aa  797    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  72.94 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  73.52 
 
 		 389 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  71.03 
 
 		 390 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  71.47 
 
 		 389 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  65.55 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  63.05 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  62.18 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  61.14 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  61.5 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  60.63 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  60.52 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  58.91 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  60.94 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  60.16 
 
 		 389 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  59.43 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  58.81 
 
 		 386 aa  454  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  59.79 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  58.4 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 		 388 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  56.77 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  52.33 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  48.03 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  39.24 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  38.01 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  36.83 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.79 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  37.88 
 
 		 390 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.22 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  37.06 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.12 
 
 		 392 aa  212  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.48 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.96 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.06 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  37.19 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.8 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  37.14 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.48 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.89 
 
 		 401 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.77 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.54 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.1 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.2 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  38.12 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.75 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  37.67 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  36.22 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  35.8 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  35.51 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  35.84 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.34 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  36.83 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  36.36 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.13 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  37.8 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  35.04 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  35.05 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.43 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.4 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  36.26 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.29 
 
 		 388 aa  176  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.18 
 
 		 388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.76 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0865761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.58 
 
 		 387 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  35.01 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.19 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  33 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.02 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  32.86 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3159  acetyl-CoA acetyltransferase  36.52 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3099  acetyl-CoA acetyltransferase  36.52 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.42 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.2 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3119  acetyl-CoA acetyltransferase  36.52 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0259344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.28 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.92 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  33.33 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 398 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.27 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  31.59 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.42 
 
 		 413 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>