More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6598 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
388 aa  792    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  79.43 
 
 
389 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  91.49 
 
 
388 aa  740    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  79.95 
 
 
389 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  79.18 
 
 
389 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  77.89 
 
 
389 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  77.38 
 
 
389 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  78.66 
 
 
389 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  77.98 
 
 
388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  63.73 
 
 
395 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  64.6 
 
 
389 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  62.95 
 
 
389 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  61.98 
 
 
389 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  62.18 
 
 
389 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  60.98 
 
 
390 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  60.68 
 
 
389 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  61.2 
 
 
386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  64.25 
 
 
389 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 
392 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  57.47 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 
389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  56.25 
 
 
460 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  61.46 
 
 
388 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  61.46 
 
 
394 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
394 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  55.09 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 
397 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  54.81 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  52.86 
 
 
392 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  37.02 
 
 
390 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.57 
 
 
387 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 
390 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  35.23 
 
 
388 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.37 
 
 
388 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.16 
 
 
386 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.93 
 
 
387 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.14 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
395 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 
392 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.81 
 
 
390 aa  193  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.29 
 
 
391 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.09 
 
 
387 aa  192  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.73 
 
 
387 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.51 
 
 
392 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.06 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.84 
 
 
388 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.69 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  33.5 
 
 
394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.1 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.23 
 
 
392 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  37.02 
 
 
407 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.23 
 
 
392 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.15 
 
 
401 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  36.63 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.65 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  32.82 
 
 
396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.6 
 
 
392 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.57 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.82 
 
 
387 aa  172  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.97 
 
 
378 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 
387 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.19 
 
 
388 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
392 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  33.59 
 
 
388 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.44 
 
 
386 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.64 
 
 
387 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.39 
 
 
384 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.23 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.04 
 
 
384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.54 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.1 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.02 
 
 
387 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.76 
 
 
413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
405 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  33.53 
 
 
392 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 
406 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
394 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  34.28 
 
 
388 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 
398 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.93 
 
 
387 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  29.97 
 
 
404 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.85 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  33.5 
 
 
395 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  33.5 
 
 
395 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  33.85 
 
 
409 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.08 
 
 
397 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  32.16 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
401 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  29.95 
 
 
401 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  31.88 
 
 
386 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  33.43 
 
 
412 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.46 
 
 
413 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  30.93 
 
 
393 aa  149  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>