More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1006 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
409 aa  833    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0865761  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  60.74 
 
 
406 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  55.39 
 
 
407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  54.09 
 
 
401 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  53.01 
 
 
412 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 
405 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3099  acetyl-CoA acetyltransferase  51.22 
 
 
410 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3159  acetyl-CoA acetyltransferase  51.22 
 
 
410 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3119  acetyl-CoA acetyltransferase  50.98 
 
 
410 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0259344  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  37.87 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 
390 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  37.57 
 
 
389 aa  196  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  37.68 
 
 
388 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 
395 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.64 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  36.41 
 
 
388 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 
389 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  36 
 
 
389 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 
390 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 
388 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  29.95 
 
 
388 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.16 
 
 
386 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.48 
 
 
390 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  35.98 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  32.67 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  32.37 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  31.64 
 
 
387 aa  163  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  31.66 
 
 
386 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.2 
 
 
392 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  32.84 
 
 
394 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  31.95 
 
 
389 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  33.66 
 
 
392 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  31.99 
 
 
389 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.53 
 
 
389 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
386 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.37 
 
 
392 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.45 
 
 
392 aa  156  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.17 
 
 
398 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  33.74 
 
 
389 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  31.95 
 
 
389 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  33.69 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  33.43 
 
 
389 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  32.43 
 
 
388 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  30.46 
 
 
388 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.54 
 
 
394 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  32.28 
 
 
388 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  31.5 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.61 
 
 
388 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  30.96 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  32.29 
 
 
388 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  28.05 
 
 
384 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  31.31 
 
 
398 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.78 
 
 
388 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  29.02 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.85 
 
 
387 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  28.68 
 
 
387 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  29.98 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  28.88 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  32.2 
 
 
388 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  32.2 
 
 
394 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 
398 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.52 
 
 
384 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  30.07 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  28.64 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  29.89 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  28.88 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  29.61 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.76 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  30.1 
 
 
401 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.2 
 
 
383 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  32.14 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.02 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.01 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.54 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  28.4 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  29.02 
 
 
396 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  29.02 
 
 
400 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  29.51 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  29.71 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  25.96 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  28.32 
 
 
395 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  28.97 
 
 
390 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  32.97 
 
 
388 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  27.79 
 
 
401 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  29.6 
 
 
383 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  26.15 
 
 
404 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  28.27 
 
 
413 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  29.46 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.52 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.21 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.68 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.12 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  27.32 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>