More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3239 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
398 aa  809    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  65.74 
 
 
400 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  66.25 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  61.1 
 
 
404 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  62 
 
 
401 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.78 
 
 
394 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  46.48 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  49.13 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.91 
 
 
387 aa  236  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  38.6 
 
 
386 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  38.28 
 
 
388 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.37 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 
391 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  37.17 
 
 
387 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  35.42 
 
 
392 aa  206  6e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  34.33 
 
 
396 aa  206  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  35.94 
 
 
388 aa  206  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  33.84 
 
 
395 aa  204  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.48 
 
 
386 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.95 
 
 
392 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.6 
 
 
387 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.73 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  37.64 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.96 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.91 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 
397 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.18 
 
 
392 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.79 
 
 
392 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  36.9 
 
 
387 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.61 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 
387 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  34.4 
 
 
394 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
392 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.6 
 
 
387 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 
395 aa  186  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  37.34 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.17 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 
392 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.62 
 
 
387 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  36.67 
 
 
392 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 
387 aa  180  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 
386 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.67 
 
 
384 aa  176  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.42 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  34.62 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  34.1 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.92 
 
 
397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  34.72 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  31.69 
 
 
392 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.67 
 
 
414 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  34.24 
 
 
389 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
389 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 
389 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 
388 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  33.25 
 
 
413 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.99 
 
 
395 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.99 
 
 
395 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.99 
 
 
409 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.68 
 
 
384 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.97 
 
 
388 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  34.73 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  32.68 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  34.27 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  34.49 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.27 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  32.73 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.83 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  33.94 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.98 
 
 
388 aa  162  6e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 
389 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 
389 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  33.01 
 
 
389 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  31.09 
 
 
413 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.9 
 
 
392 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  33.16 
 
 
413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  33.16 
 
 
413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.25 
 
 
407 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 
413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  34.07 
 
 
395 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  34.26 
 
 
389 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  30.47 
 
 
460 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  32.04 
 
 
380 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  34.2 
 
 
388 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.14 
 
 
397 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  32.04 
 
 
380 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  32.04 
 
 
380 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 
389 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.8 
 
 
382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  31.81 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  31.77 
 
 
393 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  35.29 
 
 
394 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  31.78 
 
 
394 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  34.29 
 
 
384 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.71 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  33.74 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  31.34 
 
 
388 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  34.67 
 
 
389 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  31.19 
 
 
388 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>