More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3272 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 386 aa  783    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  58.96 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  57.74 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  55.91 
 
 		 389 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  54.81 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  53.77 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  56.66 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  53.52 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  52.07 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  52.6 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  52.47 
 
 		 395 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  52.85 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  52.33 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  52.33 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  51.57 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  52.59 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  53.91 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  52.07 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  48.83 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  52.86 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  52.86 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  42.42 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  41.78 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  40.31 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  39.75 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  40.42 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  39.74 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.89 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  40 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  38.21 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.29 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.29 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  40.6 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.49 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.64 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  38.27 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  37.75 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  36.8 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.67 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  38.34 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.47 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.42 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  38.46 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.53 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  40.4 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.14 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.55 
 
 		 384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.28 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.28 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  40.1 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  38.46 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  39.1 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  37.27 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  37.28 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  37.57 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.7 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.58 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.06 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  36.32 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  37.46 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.99 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  37.46 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  37.46 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  37.04 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.31 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  37.46 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  36.04 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.17 
 
 		 378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  32.43 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.6 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  39.75 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.4 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.63 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.6 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  36.12 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  34.46 
 
 		 405 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  39.25 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.74 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  31.7 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  32.13 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.46 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  32.91 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  35.02 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  35.02 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  32.06 
 
 		 414 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>