More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1290 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
378 aa  761    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  68.78 
 
 
376 aa  546  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.24 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.21 
 
 
389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.47 
 
 
397 aa  301  9e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  42.89 
 
 
386 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.33 
 
 
383 aa  299  7e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.89 
 
 
386 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.74 
 
 
384 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  44.21 
 
 
395 aa  278  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 
388 aa  245  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.24 
 
 
387 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.16 
 
 
387 aa  238  9e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.46 
 
 
392 aa  235  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.73 
 
 
388 aa  235  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  36.75 
 
 
394 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.74 
 
 
392 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.47 
 
 
392 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.92 
 
 
386 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.51 
 
 
390 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.58 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.03 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.84 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.65 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  36.68 
 
 
388 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  38 
 
 
390 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.17 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.86 
 
 
394 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  35.24 
 
 
389 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  34.29 
 
 
388 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  32.89 
 
 
387 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  34.6 
 
 
386 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  32.82 
 
 
387 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.51 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.08 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  35.5 
 
 
395 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  32.05 
 
 
388 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.77 
 
 
388 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.48 
 
 
383 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  30.31 
 
 
395 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  31.68 
 
 
389 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.37 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  34.51 
 
 
389 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  35.88 
 
 
395 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 
389 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  32.4 
 
 
389 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  34.87 
 
 
394 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  33.97 
 
 
389 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.41 
 
 
407 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  32.62 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  35.74 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  34.39 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  34.29 
 
 
397 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 
392 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  33.75 
 
 
389 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  32.05 
 
 
388 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  31.97 
 
 
388 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 
389 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  32.81 
 
 
388 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  30.77 
 
 
368 aa  169  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  33.44 
 
 
389 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.32 
 
 
388 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.82 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  30.75 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  35.65 
 
 
392 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.32 
 
 
398 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 
392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  33.45 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 
388 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  31.52 
 
 
392 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  31.69 
 
 
392 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  30.65 
 
 
387 aa  160  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  29.21 
 
 
397 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  30.79 
 
 
392 aa  159  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 
368 aa  159  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  38.55 
 
 
364 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.44 
 
 
387 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  29.55 
 
 
394 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  28.68 
 
 
395 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  28.68 
 
 
395 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  28.68 
 
 
409 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1647  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.9 
 
 
360 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  30.62 
 
 
394 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 
400 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.25 
 
 
412 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  35.02 
 
 
388 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  35.02 
 
 
394 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.63 
 
 
413 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  30.73 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  30.73 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  30.77 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>