More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1855 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 401 aa  825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  62.84 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  60.3 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  62 
 
 		 398 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  63.09 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  44.91 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.77 
 
 		 394 aa  315  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.21 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  36.99 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  37.15 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  36.03 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.55 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  36.1 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.87 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  33.42 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.1 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.57 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.09 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.28 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  37.66 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.88 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.6 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.16 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 		 397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  37.88 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.33 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.88 
 
 		 387 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  35.68 
 
 		 387 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.92 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  35.82 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.25 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  33.51 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  33.73 
 
 		 395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.9 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  30.86 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.7 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  34.75 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.84 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.96 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  28.71 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.97 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  31.67 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.87 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  33.17 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.47 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  29.73 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  29.23 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  29.23 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  36.87 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.57 
 
 		 384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  30.57 
 
 		 388 aa  163  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  34.01 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  31.74 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  34 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.93 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  32.01 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  34.08 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  32.3 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.93 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.63 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  33.93 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.77 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.65 
 
 		 389 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  31.86 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  32.28 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.25 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.07 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  31.08 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  33.42 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  31.06 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  29.44 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  31.7 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  29.97 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  33.93 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  29.9 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  29.97 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  30.35 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.39 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>