More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4819 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
389 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  67.87 
 
 
389 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  67.45 
 
 
395 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 
390 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  70.44 
 
 
389 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  65.55 
 
 
389 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  63.5 
 
 
389 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  62.4 
 
 
392 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 
389 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  60.26 
 
 
389 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  59.11 
 
 
388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  59.48 
 
 
389 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  59.22 
 
 
389 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  58.81 
 
 
386 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  57.92 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 
389 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  58.44 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  58.44 
 
 
389 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  57.55 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  57.55 
 
 
460 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  58.64 
 
 
388 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  54.95 
 
 
388 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
395 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  52.44 
 
 
388 aa  346  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
386 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
397 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  52.45 
 
 
394 aa  345  8e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  46.63 
 
 
394 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  45.99 
 
 
392 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  37.72 
 
 
388 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.12 
 
 
387 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  38.32 
 
 
390 aa  222  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.66 
 
 
386 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  36.9 
 
 
390 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.46 
 
 
388 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  37.47 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  38.27 
 
 
387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  36.2 
 
 
388 aa  209  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.62 
 
 
389 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.94 
 
 
387 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.39 
 
 
397 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  36.66 
 
 
407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.53 
 
 
394 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  37.97 
 
 
388 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  35.95 
 
 
388 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 
386 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.59 
 
 
401 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.55 
 
 
384 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 
395 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.19 
 
 
384 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.16 
 
 
383 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.82 
 
 
387 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.76 
 
 
392 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  36.29 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.13 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  35.4 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  34.96 
 
 
386 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  35.46 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 
388 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.64 
 
 
376 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.18 
 
 
387 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 
392 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.01 
 
 
388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.17 
 
 
392 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  34.84 
 
 
397 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  34.84 
 
 
397 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  34.4 
 
 
401 aa  177  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 
396 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.97 
 
 
378 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  34.84 
 
 
397 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.02 
 
 
390 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.19 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  34.63 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 
392 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  34.82 
 
 
392 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.47 
 
 
394 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  33.17 
 
 
405 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  34.27 
 
 
394 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0865761  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.48 
 
 
417 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.9 
 
 
387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.73 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  31.7 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  33.43 
 
 
412 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.39 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.39 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  35.49 
 
 
409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  35.49 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  35.49 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.88 
 
 
387 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.39 
 
 
413 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  32.75 
 
 
397 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  33.73 
 
 
406 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  33.1 
 
 
406 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  33.75 
 
 
396 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  30.37 
 
 
400 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3159  acetyl-CoA acetyltransferase  35.8 
 
 
410 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.333851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>