More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2160 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
389 aa  795    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  83.46 
 
 
389 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  82.52 
 
 
388 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  84.75 
 
 
389 aa  693    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  82.69 
 
 
389 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  89.72 
 
 
389 aa  726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  86.56 
 
 
389 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  78.41 
 
 
388 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  77.38 
 
 
388 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  65.45 
 
 
389 aa  501  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 
395 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  61.5 
 
 
389 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  60.78 
 
 
389 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  61.26 
 
 
392 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  61.2 
 
 
389 aa  474  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  60.94 
 
 
389 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  59.13 
 
 
388 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  59.42 
 
 
386 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  59.48 
 
 
390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  63.02 
 
 
389 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  57.77 
 
 
388 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 
389 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  56.28 
 
 
394 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 
397 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  56.74 
 
 
460 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
395 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  58.7 
 
 
388 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  58.7 
 
 
394 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  53.51 
 
 
392 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  52.33 
 
 
386 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.68 
 
 
387 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  38.87 
 
 
390 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
387 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  37.05 
 
 
388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  36.5 
 
 
390 aa  223  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  37.28 
 
 
387 aa  222  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  37.82 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 
395 aa  215  8e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  36.27 
 
 
388 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.32 
 
 
391 aa  212  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
388 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  36.83 
 
 
390 aa  212  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 
392 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.99 
 
 
394 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.87 
 
 
387 aa  206  8e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  36.55 
 
 
388 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  36.18 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.92 
 
 
392 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  37.05 
 
 
388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.77 
 
 
392 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.77 
 
 
392 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.53 
 
 
388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.13 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.91 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.99 
 
 
392 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.26 
 
 
397 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.77 
 
 
389 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  36.71 
 
 
392 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.73 
 
 
388 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.42 
 
 
392 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  37.73 
 
 
383 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.03 
 
 
387 aa  189  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.9 
 
 
387 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  36.58 
 
 
407 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  35.84 
 
 
392 aa  186  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.9 
 
 
387 aa  186  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.1 
 
 
384 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.48 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  34.26 
 
 
388 aa  182  7e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.23 
 
 
383 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.16 
 
 
384 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.76 
 
 
378 aa  179  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.32 
 
 
386 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  35.05 
 
 
388 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  35.52 
 
 
387 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.81 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.37 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  37.09 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 
412 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  33.42 
 
 
386 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  32.33 
 
 
400 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.97 
 
 
376 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  31.51 
 
 
404 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  35.29 
 
 
406 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  33.99 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  34.28 
 
 
387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.5 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.98 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 
405 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  33.82 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.17 
 
 
392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  34.66 
 
 
386 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  33 
 
 
398 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.81 
 
 
395 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 
400 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.54 
 
 
412 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 
401 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  31.18 
 
 
421 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>