More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5670 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 389 aa  790    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  77.12 
 
 		 392 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  71.8 
 
 		 386 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  61.5 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  60.78 
 
 		 389 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  63.9 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  60.98 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  60.72 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  61.76 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  63.57 
 
 		 388 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  60.52 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  60.16 
 
 		 389 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  61.24 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  60.68 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  60.42 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  60.52 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  58.96 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  60.26 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 		 390 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  60.78 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  58.53 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  58.53 
 
 		 460 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  55.76 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  36.41 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.81 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.7 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.71 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.55 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.02 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.29 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.69 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.92 
 
 		 387 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.96 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  35.04 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.25 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  33.94 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.19 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  34.92 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.56 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.52 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  33.98 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  34.05 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.32 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  33.42 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  35.16 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.25 
 
 		 401 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  33.33 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.88 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  34.57 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.57 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1006  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 		 409 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0865761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.5 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.99 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.29 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.67 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  32.67 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  34.16 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.59 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  34.1 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  34.1 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  34.1 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  32.99 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  31.97 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.42 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  34.33 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.89 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  29.63 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  29.97 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  34.26 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.37 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.02 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.58 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.05 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  31.68 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  31.59 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.81 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  31.87 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  31.61 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.96 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  31.69 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.67 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.71 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.15 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.19 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  31.12 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  30.73 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  30.1 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>