More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1309 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
387 aa  783    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  64.51 
 
 
387 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 
391 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  62.21 
 
 
390 aa  491  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  64.77 
 
 
387 aa  490  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
392 aa  467  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  55.13 
 
 
396 aa  423  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  53.61 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
387 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  42.46 
 
 
387 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 
388 aa  282  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
388 aa  276  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 
387 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 
386 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  41.54 
 
 
394 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.65 
 
 
392 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.05 
 
 
392 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.29 
 
 
392 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  39.8 
 
 
387 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  39.69 
 
 
386 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  38.48 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  38.64 
 
 
392 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  38.32 
 
 
387 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  39.43 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  39.43 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  38.96 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.21 
 
 
387 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  38.64 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  39.54 
 
 
388 aa  229  9e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  39.2 
 
 
390 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  40.52 
 
 
387 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  36.63 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  36.63 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  39.03 
 
 
392 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.14 
 
 
413 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.57 
 
 
413 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  36.52 
 
 
407 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.27 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  38.76 
 
 
388 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  37.5 
 
 
388 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.92 
 
 
417 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.7 
 
 
384 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.18 
 
 
384 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.66 
 
 
388 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  36.47 
 
 
421 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.18 
 
 
397 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.82 
 
 
389 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  37.99 
 
 
401 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  35 
 
 
412 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  35.41 
 
 
413 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  37.28 
 
 
386 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  35.64 
 
 
390 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  37.13 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.32 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  36.92 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  35.6 
 
 
401 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.39 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  35.82 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.77 
 
 
376 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  36.76 
 
 
396 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  37.11 
 
 
386 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.19 
 
 
386 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 
404 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.53 
 
 
395 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  35.49 
 
 
400 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  36.25 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  35.32 
 
 
382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  35.24 
 
 
406 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.29 
 
 
394 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  37.06 
 
 
394 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  36.39 
 
 
389 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  36 
 
 
395 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  35.9 
 
 
389 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  32.01 
 
 
413 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.66 
 
 
383 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  35.89 
 
 
389 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  33.75 
 
 
393 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.79 
 
 
378 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30 
 
 
371 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  35.12 
 
 
397 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  35.12 
 
 
397 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  35.12 
 
 
397 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  33.33 
 
 
413 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  35.34 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  36.24 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  36.92 
 
 
383 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  36.14 
 
 
395 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  37.91 
 
 
395 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 
394 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  36.1 
 
 
394 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  34.13 
 
 
388 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  35.1 
 
 
395 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.89 
 
 
395 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  35.84 
 
 
394 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  36.13 
 
 
388 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  36.67 
 
 
394 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  36.08 
 
 
460 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>