More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1006 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  100 
 
 
388 aa  769    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.91 
 
 
388 aa  552  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  70.36 
 
 
388 aa  543  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  68.3 
 
 
388 aa  511  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  68.39 
 
 
388 aa  513  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  65.8 
 
 
387 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  47.03 
 
 
386 aa  316  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  43.67 
 
 
388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  44.59 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  42.67 
 
 
388 aa  301  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  43.93 
 
 
387 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  44.9 
 
 
394 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  42.12 
 
 
388 aa  296  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.86 
 
 
392 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 
390 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  42.49 
 
 
387 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.53 
 
 
392 aa  288  8e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.53 
 
 
392 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  44.64 
 
 
390 aa  285  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  42.01 
 
 
387 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
391 aa  273  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.73 
 
 
387 aa  270  4e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 
390 aa  268  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 
392 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 
392 aa  263  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 
392 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  39.49 
 
 
392 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  41.6 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 
388 aa  258  9e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  41.51 
 
 
392 aa  257  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  39.09 
 
 
395 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  37.82 
 
 
394 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.79 
 
 
386 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.37 
 
 
389 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  39.53 
 
 
386 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.28 
 
 
383 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.85 
 
 
384 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  39.33 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.5 
 
 
397 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.95 
 
 
384 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  38.76 
 
 
387 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  38.28 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.67 
 
 
387 aa  220  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  37.79 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.49 
 
 
417 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  40.1 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  38.36 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.6 
 
 
386 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  37.05 
 
 
389 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 
389 aa  202  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  35.66 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  37.6 
 
 
397 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  36.06 
 
 
395 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  39.12 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.76 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.35 
 
 
383 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3870  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.82 
 
 
384 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  38.17 
 
 
389 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  35.05 
 
 
413 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 
388 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  37.4 
 
 
388 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  36.05 
 
 
413 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  36.86 
 
 
392 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  36.76 
 
 
389 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  32.2 
 
 
407 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  37.85 
 
 
388 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  35.84 
 
 
388 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  36.43 
 
 
460 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  35.29 
 
 
389 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  35.09 
 
 
389 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 
390 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  35.7 
 
 
392 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.39 
 
 
378 aa  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 
389 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.37 
 
 
413 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  32.2 
 
 
412 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.67 
 
 
378 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  32.37 
 
 
413 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  32.37 
 
 
413 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 
386 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  33.08 
 
 
390 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.37 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  30.41 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.14 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.86 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  33.68 
 
 
392 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.13 
 
 
394 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.41 
 
 
421 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.39 
 
 
398 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  31.74 
 
 
400 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
389 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  33.24 
 
 
368 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  31.83 
 
 
413 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  34.22 
 
 
369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1143  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.78 
 
 
388 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525995  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.2 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>